本发明公开了一种脉冲多级粉灰加密系统和方法，该系统包括多级加密单元和智能控制单元；每级加密单元依次设置有灰管、加密罐体、多组脉冲喷吹加密系统、加密灰仓和卸料系统；灰管设置在加密罐体上方；多组脉冲喷吹加密系统设置在加密罐体内，加密灰仓设置在加密罐体下方，卸料系统设置在加密灰仓下方；每组脉冲喷吹加密系统包括压力管道和加密阀，压力管道用于连接外部压缩空气。卸料系统与下一级加密单元的灰管连接，用于将粉灰输送到下一级加密单元，使下一级加密单元对粉灰进行再次加密，直至多级加密单元将粉灰加密到预设目标密度。本发明可以提供高压力、间断性的脉冲气流，提升加密效率的同时，提高可以粉灰加密的密度上限值。