本发明涉及先进制造技术领域，公开了一种基于不相溶相辅助填充的图案化多层结构构建方法。所述图案化多层结构构建方法，包括以下步骤：S1、将组装单元分散于可固化水相中，得到预组装液；S2、在组装腔室的底层加入所述预组装液，上层加入不相溶相至与组装腔室上沿平齐，施加驻波，使所述组装单元在预组装液中形成图案，固化所述预组装液，得到第一结构层；S3、除去所述不相溶相，于所述第一结构层表面加入组装液，再次加入不相溶相至与组装腔室上沿平齐，施加驻波，使所述预组装液中的组装单元形成图案，固化所述预组装液，得到第二结构层；S4、重复步骤S3，得到图案化多层结构。