本发明公开了亚临界水热解全量化处理畜禽粪污资源再生系统及方法，其中，再生系统，包括：计量缓存设备，用于接收粪污原料和秸秆辅料，配制混合料；亚临界水热解反应釜，用于接收混合料，对混合料进行亚临界水热解工艺反应程序；固液分离设备，用于对出釜的水热解物料进行固液分离；好氧发酵区，用于堆放固液分离后的固体物料；高温厌氧发酵处理装置，用于接收固液分离后的液体物料，生产沼气；沼气净化储存装置，用于接收和储存生产的沼气，向蒸汽发生器提供燃气能源。本发明可对粪污有机废弃物具有强大分解能力，在对有害物质、臭味实现快速、高效的消杀处理同时，还具有对粪污中有机营养物质进行快速降解、小分子化，可以作肥料、饲料资源利用。