本发明涉及一种铜藻中多酚类化合物及其提取方法和应用，其中，该方法包括以下步骤：S1、采用单宁酶‑超声辅助法对铜藻进行处理，得到铜藻多酚粗提液，减压浓缩，除去乙醇后对剩余含水部分进行分级萃取，所述分级萃取使用的萃取剂依次为石油醚、乙酸乙酯和正丁醇，得到四个萃取层；S2、将乙酸乙酯层提取物进行葡聚糖凝胶Sephadex LH‑20柱层析，以甲醇进行洗脱，收集，根据流出时间的先后顺序，将收集到的流出液合并为3个组分，Fr1、Fr2和Fr3；S3、用二氯甲烷对合并组分进行二次萃取，得到铜藻多酚类化合物。本发明通过建立单宁酶耦合超声辅助的方法得到铜藻多酚粗提液，以最大限度破坏细胞壁，达到有效提高铜藻多酚提取率的目的。