本发明涉及渔业养殖平台运动分析领域，具体涉及一种深远海渔业养殖平台运动的非线性分析方法。该方法获取渔业养殖平台每个周期中的运动信号以及周期每个时刻多维度的环境数据，将历史周期的短时窗口的运动信号段分解成多个正弦波，在历史周期中筛选出有效窗口，根据环境数据对各周期聚类，将当前周期所在聚类簇中所有历史周期的有效窗口中初始相位相同的正弦波划分到同一正弦波集合，分析各正弦波集合的正弦波数量以及正弦波振幅，通过获取的噪声因子和劣化因子对当前周期的运动信号滤波，并对渔业养殖平台在当前周期的非线性运行进行分析，本发明消除了噪声和平台结构劣化对渔业养殖平台非线性运动分析的影响，提高对其非线性分析的准确性。