本发明涉及一种硅基复合材料及其制备方法与应用。所述硅基复合材料为核壳结构，包括多孔球形硅/硬碳内核以及包覆在所述多孔球形硅/硬碳内核表面的碳层，所述多孔球形硅/硬碳内核包括多孔球形硬碳颗粒以及分布在多孔球形硬碳颗粒孔隙中的硅颗粒。硅基复合材料的制备方法：将液相碳源A和磺酸盐混合均匀，加入催化剂，水热反应得到液相碳源B；将液相碳源B干燥、碳化得到球形硬碳颗粒，加入活化剂使球形硬碳颗粒多孔化，得到多孔球形硬碳颗粒；在多孔球形硬碳颗粒上裂解沉积硅，制备得到多孔球形硅/硬碳内核；最后在多孔球形硅/硬碳内核上制备碳层，即得到所述硅基复合材料。本发明提供的硅基复合材料抗压能力提高，粉化可能性降低。