本发明涉及水疗和理疗组合式在线纠姿的水中康复系统控制方法，包括如下步骤：S1、训练工况的设定；S2、在线纠正运动姿态。本发明一方面不仅能够形成训练工况差异，以满足不同用户的康复需求，增强实用性；而且基于水中的运动姿态，能够有效进行冲浪阻力大小和方向、理疗器释放能量的强弱及环形跑步带入水的深度和运行的速度调节，以在线纠正运动姿态，改善康复效率和康复品质；另一方面将理疗和水疗进行结合，有效的刺激损伤部位的反射点，进一步改善康复效率和康复品质。