本发明涉及有机太阳能电池的技术领域，具体涉及一种基于交联结构的逐层加工有机太阳能电池器件及其制备方法。一种基于交联结构的逐层加工有机太阳能电池器件，所述器件包括导电基底材料、空穴传输层、给体层、受体层、电子传输层及阴极材料，器件中含有交联结构层，交联结构层为给体层和受体层，或给体层。本发明基于传统的逐层加工有机太阳能电池器件，在保留LBL器件层厚和结晶度可单独控制，进一步在给体层引入可紫外光固化的交联单元，在器件制备过程中给体层形成交联薄膜，交联后的给体薄膜不溶于常规的有机溶剂，可有效防止受体层溶液加工时对其给体层表面产生的溶解和侵蚀。