本发明公开了一种β‑环糊精衍生物的制备方法及其应用，属于环糊精衍生物合成技术领域，所述制备方法由以下步骤组成：制备氨基改性的介孔二氧化锰，制备碱处理后的介孔二氧化锰颗粒，混合反应；所述混合反应，将β‑环糊精溶液倒入反应容器中，再加入对甲苯磺酰氯，室温下搅拌，冰水浴条件下加入碱处理过的介孔二氧化锰颗粒，搅拌，然后过滤出碱处理过的介孔二氧化锰颗粒；将冷却的滤液通过沸水浴加热后通入碱处理过的介孔二氧化锰颗粒进行过滤，然后将滤出液进行纳滤，调pH，冷藏静置，待沉淀完全，过滤，洗涤，重结晶，真空干燥；本发明能够获得高收率、高稳定性的β‑环糊精衍生物产品，而且具有工业可控性，操作简单，无毒。