本发明涉及医疗设备清洁领域，尤其涉及一种软式内镜清洁机。为了解决在软式内镜的侧床清洁工作中，清洁液上悬浮的部分污染物会重新粘附在软式内镜前端部的技术问题。本发明提供了这样一种软式内镜清洁机，包括有升降单元、定位单元和下部清洁单元；升降单元的上侧连接有定位单元；升降单元上侧的中部连接下部清洁单元。在本发明中，通过设有的内窥镜清洁部件，能够避免物镜被再次污染的现象发生，通过设有的内窥镜自清洁部件，在对清洁物镜的部件进行自清洁工作时，能够避免甩飞的污水将物镜污染，并且带有的自清洁部件，能够使软式内镜的侧床清洁工作，按物镜的清洁程度反复进行，提高了对软式内镜的侧床清洁工作效率。