本发明公开了一种离子液体改性的壳聚糖衍生物及其制备方法和应用，包括制备酚化改性壳聚糖、制备锌配位离子液体以及制备离子液体改性的壳聚糖衍生物3个步骤，本发明通过对壳聚糖进行酚化改性，增强了壳聚糖的水溶性和生物活性，并且酚类具有氧化性，有一定的杀菌作用，提高了壳聚糖的抗菌性能，然后通过曼尼希反应将锌配位离子液体接枝在壳聚糖上，使壳聚糖衍生物材料具备良好的力学性能，并且离子液体具有较大的比表面积，通过静电力吸附细菌，然后利用活性基团和锌离子达到杀菌的目的，此外，离子液体中的长烷基链易进入细菌细胞膜的疏水区域，改变细胞膜的通透性和细胞渗透压，进而杀死细菌，进一步提高了壳聚糖的抗菌性能。