本发明提供一种软X射线化学电离源，包括试剂主离子发生器、多反应时间耦合器和化学电离采样区。所述试剂主离子发生器通过在设计为中间大两头小的流体线性结构的发生腔体两端设置软X射线源来对发生腔体内的试剂施加电场从而产生主离子，主离子采用径向方式进入化学电离区与待测物之间发生化学反应，试剂主离子发生器和化学电离区连接处还设置有多反应时间耦合器，可根据需要提供多个化学电离反应时间。本发明提供的软X射线化学电离源，具有环境友好，电离效果较佳，化学电离时间可调，使用简单而且安全的优点。