本发明提供了一种聚酰胺复合膜及其制备方法，所述聚酰胺复合膜包括支撑层、改性层和聚酰胺层；所述改性层生长在支撑层上；所述聚酰胺层生长在改性层上；所述聚酰胺层采用的原料组分包括多元胺、多元酰氯和空心聚多巴胺微球；所述空心聚多巴胺微球的直径为50‑200nm；所述改性层用于调控聚酰胺层的厚度和交联度。所述制备方法包括步骤1、制备支撑层；步骤2、在所述支撑层上生长改性层，得到复合层；步骤3、在所述复合层的改性层上生长聚酰胺层，得到聚酰胺复合膜。本发明所制备的聚酰胺复合膜能够保持在高截留率的情况下，有效提升水通量，提高了聚酰胺复合膜的渗透效率。