本发明公开了一种水声OFDM接收机中时频域联合抑制ICI的方法和系统，属于水声无线通信技术领域。包括：利用分段快速傅里叶变换P‑FFT中信号分段的方式，将一个OFDM块持续时间内的基带接收信号分段为多个非重叠短信号；借鉴分数快速傅里叶变换F‑FFT在多个频率上进行傅里叶变换的思想，对每个分段后的非重叠短信号在载波频率和以特定基准偏移频率的分数倍偏移载波频率的多个频率上进行傅里叶变换，从而在每个载波处产生多个输出；将每个载波处的多个输出加权合并成一路，用于符号检测，并利用随机梯度算法求解和更新加权合并的权重。本发明通过结合了P‑FFT和F‑FFT的特点，联合时域和频域抑制ICI，在多普勒因子和载波数都较大的情况下，性能有显著的提升。