本发明公开了一种面向数据报文的双队列同步方法、系统、设备、存储介质，其中方法步骤如下：获取报文参数，根据报文实时性的需求分成实时报文队列和非实时报文队列；基于时延敏感信息标识将高时敏报文存入实时报文队列，将低时敏报文存入非实时报文队列；针对非实时报文，依据报文目的节点标识，对相同目的节点的报文，采用基于动态规划的报文合并算法，将多个非实时报文以协议预定的方式组合成IP报文数据区，共享一个IP头，实现将对应的非实时报文合并打包，进行合并报文格式同步执行策略；针对实时报文，按照实时报文产生时刻顺序完成单一报文格式同步执行策略。本发明在保障实时报文需求的同时，通过报文合并的方式，降低非实时报文的同步频次及IP头开销的目的。