本发明公开了一种针对于直流接地极线路的复合频率叠加保护方法，步骤1、持续地通过高频电流源向接地极线路中注入频率分别为f1、f2的高频信号；步骤2、于接地极线路正常运行时，获得频率分别为f1、f2的高频信号对应的的测量阻抗Zn1、Zn2；步骤3、每经过一个预先设定的判断周期T，利用FFT计算频率f1信号接地极线路首端电流相量和电压相量并计算测量阻抗步骤4、判断频率f1信号对应的测量阻抗Zf1是否满足式(3)，选择告警；步骤6、判断频率f2信号对应的测量阻抗Zf2是否满足式(4)，选择告警或正常运行。本发明能够较为准确判断接地极线路的故障发生，提高保护的准确性、灵敏性，能够大幅改善其保护性能的方法；大幅消除了单一频率信号注入时的死区问题。