本发明提供一种热通量测量系统。所述热通量测量系统(100)具备：第一导线束(1)；第一热通量传感器(31)，在第一导线束(1)的中途仅设置有一个；第二导线束(2)，在第一导线束(1)中的比第一热通量传感器(31)更靠第一端(1a)侧连接有第一端(2a)且由与第一导线束(1)相同的材料构成；第二热通量传感器(32)，在第二导线束(2)的中途仅设置有一个；第一检测部(61)，检测第一导线束(1)的两端之间的电压；及第二检测部(62)，检测第一导线束(1)的第一端(1a)与第二导线束(2)的第二端(2b)之间的电压。