本发明提供了一种抗菌天然橡胶及其制备方法和应用，属于橡胶材料技术领域。本发明提供的抗菌天然橡胶，按质量份数计，包括以下制备原料：干胶计天然橡胶胶乳100份；水滑石1～10份；硝酸银0.2～3份；β-环糊精0.1～3份；干胶计乳状环氧化天然橡胶0.2～2份。本发明中水滑石作为银离子的载体，并利用β-环糊精对水滑石进行改性，同时利用乳状环氧化天然橡胶提高水滑石在最终所得抗菌天然橡胶中的分散性，使所述抗菌天然橡胶在具有良好抗菌性能的同时还具有较好的力学性能和较低的生热性能。