本发明公开了一种微生物的取样机构，包括滴管和套管，套管的中部成型有圆形通孔，滴管的顶端成型有L形的折弯部，折弯部由水平部和竖直部组成，竖直部插接在套管下端的圆形通孔中；竖直部内插接有倒置的试管，圆形通孔的上端相对的内侧壁上成型有两条竖直的插接槽，插接槽内插接固定有支撑轴承，支撑轴承内插套有竖直的连接杆，连接杆的侧壁上成型有与试管的外侧壁相对应的弧形夹片，连接杆与插接槽的内壁之间固定连接有若干拉伸弹簧；套管下部外侧壁上成型有竖向的凹槽，凹槽内插接有限位板的导向块，限位板的下端成型有铰接轴，止挡板的上端铰接在铰接轴上。本发明方便对微生物进行取样测试，取样后方便进行清洗，以便再次取样使用。