本发明公开了一种对采用曼彻斯特编码的电子式互感器采集数据，进行高精度同步解码处理的方法，主要应用于智能化变电站或数字化变电站中，属于电力系统及其自动化领域，本发明通过可编程逻辑控制器解码IEC60044-7/8报文的同时，还输出数据帧同步脉冲信号；通过测量数据帧同步脉冲信号及时钟信号，对数据进行插值处理；可同时生成同步采样数据及非同步采样数据。本发明的方法综合利用了脉冲同步法及插值法各自的优点，解决了智能变电站或数字化变电站中电子式互感器数据与时间同步的难点，且不涉及对电子式互感器进行较大的同步采集技术改造。